Główny bohater i jego brat, Lincoln Burrows (Dominic Purcell) obwiniają Firmę o zniszczenie im życia, bo obarczyła ich odpowiedzialnością za zbrodnie, których nie popełnili. Zemsta jeszcze się nie dopełniła – trafiamy w sam środek morderczej rozgrywki. Ostatni genialnie precyzyjny plan Michaela powiódł się i... razem z przyjaciółmi ukradł z samej siedziby Firmy przenośny dysk komputerowy, o kryptonimie Scylla - tajny notatnik, który zawiera listę agentów i dane o operacjach tej przestępczej grupy. Niestety, stracili łup, bo zdradził ten, który wydawał się poza podejrzeniem - agent Don Self (Michael Rapaport) z Departamentu Bezpieczeństwa. I znów byli ścigani... Największa ucieczka w historii telewizji trwa dalej – będziemy świadkami nie tylko dramatycznej walki o życie, ale przede wszystkim wielu brawurowych sytuacji i zaskakujących zwrotów akcji. Ten serial potrafi nieustannie trzymać w napięciu. Najnowszy odcinek otwiera scena, w której Sara (Sarah Wayne Callies) nalega, by Michael jak najszybciej poddał się operacji mózgu – w przeciwnym razie umrze. Ale on zgodzi się pójść do szpitala, dopiero gdy zakończy pomyślnie operację „Scylla”. Nic do siebie nie mają, chodzi tylko o interesy – Don Self uprowadził Gretchen (Jodi Lyn O’Keefe), by doprowadziła go do Scofielda, który już czeka na nią w wyznaczonym miejscu. Ale Lincoln uprzedza jego ruch... Nawet gdyby tym razem wyjątkowo Gretchen chciała zachować się lojalnie wobec nowych sojuszników, pamięta, że Self pozostawił T-Baga (Robert Knepper) w domu jej siostry i polecił mu zabić Ritę i Emily, jeśli oni nie wrócą w ciagu dwóch godzin. Tymczasem u drzwi zjawia się domokrążca, sprzedający Biblię - teraz T-Bag znów jest „więźniem” swojej tożsamości, byłym skazańcem... Natomiast Alex Mahone (William Fichtner) robi, to co potrzeba – kontaktuje się z jedyną osobą, której może zaufać w FBI, agentką Wheeler, by przekazać jej bezcenne informacje na temat Firmy i też spotyka go przykra niespodzianka. Dla byłej koleżanki z Biura i jej nowego szefa jest on tylko zbiegiem... Generał Krantz ma również ciężki dzień – wciąż nie odzyskał Scylii. A na domiar złego, jego córka, Lisa i zarazem najbardziej zaufana osoba w Firmie składa rezygnację. Już wie, kim naprawdę jest jej ojciec. Śmiertelna rozgrywka wydaje się dobiegać końca. Gretchen i Self czekają w hotelu na spotkanie z kupcem, który oferuje setki milionów dolarów za Scyllę, i są przekonani, że nic nie zdoła im pokrzyżować planów, bo przygotowali odpowiedni arsenał do obrony. Raz jeszcze nie doceniają Scofielda i jego drużyny. Gdy jednak po brawurowawej akcji Michael odbiera łup, sytuacja diametralnie zmienia się. Znów Firma wkracza do gry i staje się najgorsze...